目前已培育出抗马铃薯环腐病的品种，但没有免疫品种，因此通过严格的防病程序生产无病种薯，仍是目前的主要防治方法。

　　1、建立无病留种田，生产无病种薯。当年种植的马铃薯田中，在开花期进行严格的田间检查，选择健康植株，做上记号。收获时，先将做标记的健康种薯单收单贮，供下年留种用。

　　2、拔除病株与淘汰病薯。盛花期，深入田间调查，发现病株，及时连同薯块挖除干净，这时降低发病率，有一定效果；种薯入窖时，挑除病薯，可避免烂窖；切种薯块时，发现病薯，及时汰除。

　　3、切刀消毒。为了消灭切刀上的病菌，在切种薯时，应严格实行切刀消毒，可用20%龙克菌500倍液放入盆中，当切到病薯时，将切刀浸入药液中，消毒5-10分钟后再用，有效防治环腐病的发生。

　　4、整薯播种。由于整薯外面有一层完整的表皮，没有利于环腐病菌侵染的种薯切面，因此可有效地防止环腐病的发生，避免了切刀传病。根据多年试验，整薯播种的发病率为3%-8%，切块的发病率为10%-19%。另外，整薯播种在我国南方具有抗种薯腐烂的优点，在北方可起到抗旱的作用。多年的试验和实践均已证明，采用15-40g的小整薯播种，既能节约用种，又能防病增产。如果种薯过小，其繁茂性差，影响产量；种薯过大，用种量随之增加，造成种薯浪费。